Nature Methods:高通量产生干细胞的自动化创新平台

2016-11-076829点击

 

       最近,纽约干细胞基金会(NYSCF)研究所的科学家成功研制了一种创新性的、高通量机器人平台,可使患者样本转化为干细胞的过程自动化和标准化。这种独特的平台NYSCF Global Stem Cell ArrayTM,首次让研究人员能够研究不同的人群,更好地理解疾病的根本原因,并研制个性化新疗法,使精密医学能够用于病人护理。

       相关研究结果发表在最近的《Nature Methods》,表明这种高效的新技术,可使患者特异性干细胞的整个产生过程自动化,同时降低手动操作产生的可变性。该系统可收集患者样本,并将其转化为诱导多能干细胞(iPS)。该平台可以将这些iPS细胞转化为成人体内不同类型的细胞,如心肌细胞、神经细胞和肝细胞。NYSCF科学家研制的这个平台,是高度模块化的,可使定制的细胞生产,成为未解决问题的最好方法。

       本文共同作者、NYSCF研究所CEO和创始人Susan L. Solomon说:“我们的目标是了解和治疗疾病。研究人员需要在一定规模上研究基因多样性,这意味着需要制备大量标准化的人类多能干细胞。NYSCF Global Stem Cell Array的大规模并行处理能力,使这项研究成为可能。”

       这一平台可允许研究人员预期“遗传背景不同的人对新药物有何反应”。这一开创性的技术可让研究人员在将药物用于患者之前,在人类细胞(而不是动物)中确定潜在的药物代谢和毒性问题。Solomon女士解释说:“这有可能节省数十亿美元的药物开发费用,并减少人们参与这些临床试验的危险;大大减少目前用于人体临床试验的时间。”

       罗氏公司药物部高级副总裁Thomas Singer 博士说:“在培养基中测试数千名患者对药物的反应,这种能力将改变我们治疗疾病的方式。我们更能了解,在加速发现过程的临床试验阶段,受试者将如何表现。这项技术将使我们能够为更多的患者,带来高精度的药物治疗和个性化的药品。”

       将成人干细胞转化为iPS细胞所用的行业规范是费时、费力的,并且会产生不同的结果。目前,科学家们手动把皮肤细胞暴露在一种分子混合物中,使它们看起来像胚胎干细胞。这种产生iPS细胞的手动过程,会引入人为误差,所产生的细胞系之间存在变异性,另外还需要数个月的动手时间和不断关注。这种自动化的机器人平台,可使干细胞生产从一种经典的动手方法,变成为二十一世纪的高通量标准。

       麻省理工学院和哈佛大学Broad研究院Stanley精神病研究中心主任Steven Hyman博士称:“这是非营利组织共同努力,获得重要技术进步的一个很好的例子。实现规模和可重复性的能力,可大大增加干细胞疗法的效用。”

       本研究所用的600多份皮肤样本,来自于被确诊为疑难疾病、心理健康状况、神经退行性疾病(如帕金森和阿尔茨海默氏病),和其他疾病的人,以及那些没有已知疾病的人。从这些患者制备特定类型的细胞,首次让科学家能够将来自人类基因组的数据,与全球人口遗传多样性数据合并,对“不幸的遗传和环境因素如何可能促进发病”提供了新的见解。此外,该平台产生的细胞绝对数量,可为研究人员得出更广泛的结论和有统计学意义的数据,提供力量。

       Michael J. Fox Foundation 首席执行官Todd Sherer没有参与这个平台的研发,但是他指出:“利用NYSCF Array所产生的细胞系,是一种重要的工具,可帮助我们更好地理解和开发新的治疗方法,防止或减缓帕金森病的进展,尤其是,可与新兴的综合性生物标志物数据相结合。在人类细胞中快速测试假说的能力,将给我们的研究带来极大的益处。”

       患者的细胞被重编程为iPS细胞后,这一平台可选择具有相似生长特性的细胞,用于进一步研究。研究表明,当手动完成时,产生患者特异性干细胞中的这一步骤,会在细胞株之间引入显著变异性。来自技术的这种变化可能隐藏患者之间的重要遗传差异。这一平台可使产生的多能性细胞系之间的噪声降低,使研究人员能够检测到遗传差异。此外,这一平台还使得成年细胞转化为iPS细胞的效率大大提高。

       本文资深作者、NYSCF 干细胞研究副主席Scott Noggle解释说:“对于许多常见的疾病,如糖尿病和阿尔茨海默氏症,利用干细胞模型来了解这些疾病,一直依赖于一些罕见的基因突变,它们只影响所有患者中的一小部分。然而,使用干细胞模型,我们很难研究影响大多数患者的更常见的遗传危险因素。我们的自动化系统将使我们能够开展大型干细胞实验,来了解这些风险因素是如何直接导致疾病的。”

原文标题:Automated, high-throughput derivation, characterization and differentiation of induced pluripotent stem cells

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